На сегодняшний день он насчитывает около 7400 предметов. Музейные коллекции формируются в ходе полевых исследований и археологических экспедиций. Очень важно, что значительную долю предметов старины, памятных личных вещей передает музейному фонду местное население. Также с целью пополнения фондов поддерживается связь с архивами, музеями, коллекционерами, мастерами народных промыслов и ремесел.
Как пояснила Раиса Дунаева, главный хранитель фондов Кенозерского национального парка, большинство предметов музейного собрания датируется XIX - началом XX вв. Основа - предметы этнографии. В составе этнографических коллекций — бытовая и хозяйственная утварь, одежда, орудия ремесел и промыслов, элементы интерьера жилища и других построек, атрибуты обрядов и верований. В совокупности они отражают своеобразие традиционной культуры коренного населения, проживающего на территории Кенозерского национального парка.
Значимой частью музейного собрания являются коллекции живописи (иконы) и народного искусства (прялки, изделия из бересты). Музейный фонд обладает самой большой в России коллекцией «небес» (живописных потолочных перекрытий деревянных храмов) — 16 комплексов.
В течение 2009 года музейные коллекции Кенозерского
национального парка пополнились на 410 единиц хранения. Это почти вдвое
превышает результаты 2008 года. Основу комплектования фонда в прошедшем году
составили вещественные предметы: орудия труда, ремесленные инструменты,
промысловые принадлежности, предметы домашнего обихода, а также предметы
письменных и фотографических источников. В 2009 году положено начало активному
комплектованию коллекции предметов периода
В музейный фонд Парка также включаются и работы современных мастеров. Среди новых поступлений — предметы ткачества, лоскутного шитья, берестоплетения. Фонд обустройства интерьеров пополнили 76 предметов — концертные костюмы для фольклорных коллективов Кенозерского национального парка. Восемь комплектов (жакет, юбка, сорока) изготовлены Архангельским Домом Текстиля под руководством Екатерины Умывакиной. 23 комплекта (кофта, юбка, повойник, кушак) для коллективов «Северяночка» и «Лекшмозерочка» изготовлены автором Светланой Пегасиной (г. Северодвинск).
В музейном
фонде Парка ежегодно проводятся реставрационные и противоаварийные работы. В
2009 году в ВХНРЦ им. Академика И.Э. Грабаря закончилась реставрация 17 граней «небес»
из часовни Святителя Николая XVIII
века в деревне Усть-Поча. Художниками-реставраторами Архангельского филиала
ВХНРЦ отреставрированы 10 предметов из металла и геометрический специальный
план-обмер участка земли на Аглимозере 18 века, проведены противоаварийные
работы на гранях «небес» часовни Тихвинской Божией Матери 1790 года д. Орлово и